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相比一类疫苗，二类疫苗的接种率太低。早在2012年，中国疾控中心发布的数据显示，我国适龄儿童国家免疫规划疫苗报告接种率达90%以上。二类疫苗目前没有类似的整体统计数据，但从一些有据可查的个案中可以看到，接种率并不乐观。比如，除了上文提及的流感疫苗接种率只有2%外，国家卫健委最近表示，用以预防手足口病的EV71疫苗在一些地方接种率只有10%，高的地方也只有50%。
二类疫苗接种率为何比一类疫苗低这么多?没有纳入国家计划免疫、需要自费是原因之一。“但问题大多出现在对疫苗的认知误区上。”郑东旖指出，很多人不了解一类疫苗(免费疫苗)和二类疫苗(自费疫苗)是如何划分的，以为一类疫苗比二类疫苗更有效、更安全。
北京儿童医院微生物研究室主任姚开虎指出，无论一类疫苗(免费疫苗)还是二类疫苗(自费疫苗)，都符合国家规定的安全有效的标准，其分类主要是由国家和各地方的疾病危害程度、经济实力决定的。二类疫苗是一类疫苗的补充，随着经济实力的加强，将来有可能变为一类疫苗，免费向公众提供。一些有条件的城市已率先将部分二类疫苗转为一类疫苗。例如，水痘疫苗和流感疫苗在北京属于免费疫苗，在其他一些省市仍要自费。还有一些进口疫苗在我国属于二类疫苗，但在其他国家属于政府免费提供，其安全性和有效性都是经过验证的。
事实上，有的二类疫苗预防的疾病，危害更大。例如HPV疫苗，虽然是二类疫苗，但它是全球首个可以预防癌症的疫苗，而且研究证实，九价HPV疫苗可预防92.1%的宫颈癌。
专家强调，一类疫苗和二类疫苗只是按免费与否的划分，并非是以疫苗的接种效果或安全性来区分。所有疫苗在获得注册前都需经过严格的动物实验和临床研究，在上市使用前都要实施严格的批签发制度。所以在安全性上，二类疫苗与一类疫苗没有区别，不能二等视之。
二类疫苗遭受的误解和忽视，与公众对整个疫苗的认识也有关系。中国疾病预防控制中心流行病学首席专家曾光多次表示，从近几年发生的疫苗事件来看，疫苗信息传播存在不科学、片面甚至误导的情况，造成舆论恐慌，让很多本该接种疫苗的儿童错过了接种疫苗的最佳时间，为相关疾病感染留下隐患。
比如，2013年发生的康泰乙肝疫苗事件，“17例新生儿接种疫苗后死亡”被广为传播，引起恐慌。后经调查证实，这17例死亡病例与疫苗无关。2016年山东发生非法经营疫苗系列案件，“假疫苗”舆论甚嚣尘上。后经调查证实，涉案疫苗并非“假疫苗”，都是正规企业生产的合格产品，只是属于非法经营。尽管这些事件的真相很快得以廓清，但公众对疫苗安全的恐慌并不能很快消除。
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（编辑：刘然）
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